龟头真菌感染一般情况下不能自愈。
因为真菌的繁殖能力较强，真菌引起的龟头炎，会导致龟头包括尿道口、包皮冠状沟处红肿、疼痛、瘙痒。如果没有及时治疗真菌不会消失，同时这些症状也不会自行恢复。另外，真菌性龟头炎如果没有及时治疗，还会诱发真菌性尿道炎，导致人尿道瘙痒、尿道灼热，影响正常排尿。
所以，建议积极治疗，以防患有真菌性尿道炎。例如可以在医师指导下龟头局部涂抹罗红霉素软膏，然后口服制霉菌素片和阿奇霉素治疗。