肩膀背部疼痛的原因与软组织损伤或病变有关，过劳及外伤后都会造成肩部、背部肌肉筋膜伤害，引起水肿或血肿疼痛，反复刺激或慢性劳损伤害还会诱发无菌性炎症，导致疼痛加重。
其次见于基础性病变。颈椎病及肩周炎都会引起肩膀背部疼痛，颈椎下节段颈5/6、6/7节段椎突后造成软组织刺激受压，引起背部疼痛。肩周炎发作时会累及整个肩袖部位出现疼痛，同时还要警惕肩部及背部出现占位性病变后造成疼痛。
应及时就医，完善该部位的X线、CT及核磁共振检查后诊断治疗。