一般在患有多囊肝的早期，除了肝大外没有什么明显的症状出现，随着病情的发展，囊肿会逐渐的增大，这个时候就会对肝脏的功能造成一定的影响，可出现腹胀、右上腹部疼痛或者是间歇性疼痛、呼吸困难等症状。
如果整个肝脏上长满了囊肿，还可能会出现肝衰竭的症状，如果压迫到胃肠等邻近的器官，还可以出现腹部饱胀感、不愿意吃东西、营养不良等症状。
如果囊肿出现破裂的时候，可以导致失血性休克、急腹症，如果囊肿出现扭转的情况，可以出现突发性上腹部剧痛、发热等症状。