晚期肝癌常见的临床表现有肝区疼痛、腹胀、纳差、乏力、消瘦、进行性肝大或上腹部包块等。部分患者有低热、黄疸、腹泻、上消化道出血、肝癌破裂后出现急腹症表现等。此外，合并肝硬化者常有肝掌、蜘蛛痣、男性乳腺增大、下肢水肿等。
发生肝外转移时可出现各转移部位相应的体征。体检时在中上腹部可扪及肿大的肝脏，或质地坚硬有触痛的硬结节。晚期患者可出现贫血、黄疸和腹水等。此类患者的临床表现类似于原发性肝癌，但一般发展相对缓慢，程度也相对较轻。多在做肝脏各种检查时疑及转移可能，进一步检查或在手术探查时发现原发肿瘤。