做乙状结肠镜检查一般是不会留下后遗症的，乙状结肠镜是临床常用的一种检查项目，可以确诊肠道多种疾病，能够在镜下清晰地观察到肠壁的黏膜是否存在有充血、水肿、糜烂、发炎，是否存在息肉、肿瘤等占位性病变。
检查后一般不会对人体造成危害留下后遗症，只是在检查过程中可能会出现腹部胀气。由于进入到肠道检查，有可能会对肠道黏膜造成轻微的损伤，不少人出现腹部不舒服、有腹胀、腹痛，主要是因为在做检查时过度紧张，做检查后一般很快可以缓解。
因此，做乙状结肠镜是不会导致后遗症的。