乙状结肠镜一般一年做一次。很多地方将乙状结肠镜列入常规的体检项目，而体检一般是1~2年做一次。
乙状结肠镜可以检查肛门、直肠以及部分乙状结肠的疾病，包括炎症性疾病、肿瘤、息肉、痔疮等。可作为大肠肿瘤的初步筛查，也可以作为直肠息肉切除术后或者溃疡性结直肠炎治疗后的复查。
因为相对结肠镜检查，乙状结肠镜肠道准备简单，检查实施方便，而且并发症以及检查风险相对偏小，更容易让患者接受。但乙状结肠镜检查也有一定的局限性，主要是检查范围有限，无法对升结肠、横结肠，以及降结肠等近端的大肠进行检查。