通过大量的临床研究表明，绝大部分宝宝的胆汁淤积，是由先天性的胆道系统解剖结构异常所致。
除此之外，怀孕期间母体内的感染，如病毒性肝炎、巨细胞包涵体病毒，和出生后的一些后天性因素，如弓形虫病、长期的静脉高营养、脑干肾综合征等，都会导致宝宝胆汁淤积。
通常情况下，如果发现宝宝胆汁淤积都需要引起足够的重视，进行对症的治疗，否则有可能导致宝宝肝硬化肝功能衰竭、新生儿出血、多脏器功能损害门脉高压综合征、瘙痒、脾功能亢进肺炎、败血症等。不但影响发育，甚至可能危及生命。