牙周脓肿和牙槽脓肿的区别表现在感染的来源、脓肿位置、牙松动度、牙髓活力、有无牙周袋、叩痛程度和X线表现，及治疗等各方面。
牙周脓肿感染来源于深牙周袋，脓肿局限在牙周袋壁、靠近龈缘、牙松动明显、牙髓活力尚存、有深牙周袋、轻度叩痛，X线表现为牙槽骨嵴破坏，病程相对较短，一般3~4天可破溃，需要牙周基础治疗。
牙槽脓肿感染来源于牙髓病或根尖周病变、脓肿较弥散、在龈颊沟附近、牙髓失活、一般没有牙周袋、叩痛明显、疼痛程度较重，X线表现为根尖周骨质破坏、病程较长，一般需要5~6天排脓，需要根管治疗。