目前治疗珍珠疹的药膏还没有研制出来，珍珠疹是一种良性改变，如果没有症状，暂时不要治疗。
如果阴茎珍珠疹合并有炎症，可以先消炎治疗，待炎症治愈后，可以采用激光疗法或者冷冻疗法来治疗，有包皮过长或者包茎者，建议通过手术切除包皮，切除包皮后注意局部卫生，每天使用清水冲洗，保持局部干燥。
阴茎珍珠疹治疗后不能有手淫习惯，手淫会导致珍珠疹复发，所以术后应该戒除手淫，养成良好生活习惯，平时可以多参加户外活动。