肛门烂了如果是由于细菌感染引起的，一般是涂抗生素软膏，在涂药之前还可以使用稀释的高锰酸钾溶液进行清洗。
如果肛门烂了是由于肛管直肠皮肤黏膜组织有溃疡的形成，是由于潮湿等原因导致的，可以涂氟芬那酸丁酯软膏或者是涂抹具有糖皮质激素成分的软膏，具有良好的止痒效果，还可以促进烂了的位置修复。在涂抹药膏之前，也建议患者使用一些中药成分的制剂做局部的清洗。
肛门烂了要先到肛肠科进行检查，找到原因以后再进行对症的治疗。还有一部分患者是发生了肛门周围皮肤癌的情况，如果有溃烂的形成需要通过手术进行治疗。如果是由尖锐湿疣等病毒性感染疾病所导致的，一般需要涂具有腐蚀性质的药物。