肛门瘙痒可以涂激素类软膏，如派瑞松软膏、糠酸莫米松软膏、氢化可的松软膏等，瘙痒症状控制后逐渐用不含激素的软膏，激素类药膏用的时间过长，会引起肛门皮肤萎缩和变薄。
治疗肛门瘙痒除了应用药膏，还可以用中草药进行肛门熏洗、坐浴，口服抗组胺类药，如扑尔敏、钙剂、氯雷他定等。瘙痒严重，导致睡眠差引起焦虑不安者，可口服镇静药，如安定。
治疗肛门瘙痒要解除病因，及时治疗能引起肛门瘙痒的全身和局部疾病。