对于有卵巢囊肿的女性，并不是必须治愈以后才能够怀孕，而是需要根据卵巢囊肿的性质、大小，以及伴随症状来选择最佳的处理方法。比如女性是卵巢普通囊肿，而且囊肿小于5厘米以下，这种情况根本就不需要治疗，而是正常备孕怀孕即可。
而对于卵巢巧克力囊肿的女性，如果巧克力囊肿大于5厘米以上，可能需要先通过腹腔镜手术，将卵巢巧克力囊肿切除，手术以后再进行备孕怀孕。
对于盆腔炎症导致的卵巢囊肿，由于这个时候炎症刺激，所以需要先进行抗炎治疗，将盆腔炎症彻底控制以后，就可以进行正常备孕怀孕。