失眠会头痛主要是因为当失眠时会导致睡眠不足，而睡眠不足会导致大脑呈现过度疲劳状态，对大脑的正常机能造成影响。而且脑内的自由基和代谢废物无法及时清除，大脑会出现缺氧以及缺乏营养的情况，还容易会出现脑供血不足，因此才会引起头痛。
尤其是长期失眠时，还容易会出现脑神经衰弱，头痛也会比较明显，甚至还有可能会导致记忆力下降。尤其是本身就患有偏头痛的患者，如果是失眠，会导致偏头痛频繁发作。如果失眠比较严重，需要通过药物调理。