耳朵根后面疼痛，可能是下列疾病造成的：
1.毛囊炎、疖肿等疾病，耳朵跟后面的皮肤存在毛囊以及汗腺，如果毛囊或汗腺感染了细菌，造成了毛囊炎或疖肿，就会出现米粒大小或者黄豆大小的皮疹，皮疹可能会有疼痛感，此类皮疹不会给患者的身体造成过大影响，通常会在1周左右的时间自行好转。
2.患者如果患有急性化脓性中耳炎、咽喉炎或扁桃体炎等疾病，炎症感染会造成病变部位有充血、红肿以及疼痛的表现，疼痛感会向耳朵根后面的部位放射，造成周围邻近器官的疼痛。