青少年牙周炎的治疗首先以基础治疗为主，做龈上洁治术、龈下刮治术，还有根面平整术。来去除牙结石，消除菌斑滞留因素及其它局部刺激因素。
教育并指导患者自我控制菌斑的方法。每天早晚都要认真刷牙，饭后用清水漱口，还应该用牙线清除残留在牙缝之间的食物残渣和软垢。对于基础治疗后仍有五毫米以上的牙周袋且探诊出血时，要进行牙周手术，比如说翻瓣术，引导性组织再生术等等。还应该要定期复查，检查患者的菌斑控制情况及其软垢、牙石、牙龈的情况。
青少年牙周炎进展较快，可能会引起牙齿的慢性松动，要及早进行松牙固定术，防止牙齿松动、脱落。