肛门白斑要祛除诱因，再给予局部治疗。引起肛门白斑病因尚未明确，可能与糖尿病、内分泌紊乱、维生素缺乏等有直接的关系。
首先要祛除诱因，如果糖尿病患者血糖不稳定，要服用药物控制血糖。内分泌紊乱可以应用激素调节，维生素缺乏要调整饮食结构，多吃新鲜的蔬菜、水果，补充维生素。肛门局部可涂抹氟轻松软膏，口服维胺酯胶囊治疗。
如果局部的皮肤过度角化，也可以涂抹维A酸乳膏。如果合并细菌感染，可以涂抹硫酸新霉素软膏、四环素软膏治疗。平时要注意肛门局部的清洁、干燥，不要用肥皂清洗肛门。