停经三个月了，如果排除了怀孕，就应该进行针对性的治疗，首先要根据年龄，还有引起停经的原因，如果是因为正常的绝经年龄停经三个月，有些并不需要进行特别的治疗。如果要提高生活质量，要缓解停经后的症状，就可以进行一些激素的补充治疗。
如果比较年轻，尤其是有生育要求的患者，就一定要查找引起闭经的原因，有些是因为多囊卵巢综合征引起的，也有些是因为卵巢囊肿导致的，或者是因为人工流产以后导致的宫腔粘连而出现停经三个月的现象，或者是由于过度减肥节食等一些因素引起的功能性闭经。
不管是哪种情况引起的闭经，都应该进行针对性的治疗，有些可以通过口服药物进行治疗，包括周期性的口服避孕药，或者其它的一些激素类药物调整月经周期，恢复月经。也有些可以通过宫腔镜下的宫腔粘连分解来进行治疗，还有一些只要通过改变生活习惯，进行饮食结构的调整，就能够恢复月经。