停经三个月了没怀孕，说明出现了月经不调。首先，如果年龄比较大，说明可能是因为卵巢功能衰退，出现了围绝经期的表现，有可能要绝经了，也有可能是由于卵巢的分泌功能出现了异常，比如多囊卵巢综合征，就会引起停经的现象。
也有些可能是因为人工流产引起了子宫内膜的损伤，导致了宫腔的广泛粘连，所以会出现停经三个月的现象，还有可能是由于长期熬夜、作息不规律，或者环境的改变、过度的节食与减肥，导致了营养不良，都有可能出现功能性的月经不调，有些可能是因为做了卵巢手术，卵巢功能遭到破坏，甚至出现了卵巢早衰。
总之停经三个月，但是又没有怀孕，有很多种可能，可以做B超检查宫腔的情况，是否存在宫腔粘连，也可以抽血查性激素六项以及AMH，来评估卵巢的功能，只有明确了病因，才能够进行针对性的治疗。