肛裂患者常用的治疗药物主要为坐浴药物、外用药物以及口服药物。
常用的坐浴药物主要为高锰酸钾溶液与消肿止痛洗剂，通常需要按照一定的比例进行稀释，通过坐浴的方法来达到消炎止痛的效果。口服药物主要为乳果糖、福松等，具有软化大便的作用，能够保证患者排便通畅，避免由于大便干硬导致排便时对肛裂部位造成刺激，致使肛裂进一步加重，从根本上解除肛裂的诱因。
外用药物主要为痔疮膏和痔疮栓。痔疮膏常用的为太宁软膏、九华膏、龙珠软膏以及灭活埃希的松软膏等，痔疮栓主要为马应龙痔疮栓、肛泰痔疮栓等。通过外用药物直接作用到患处可以促进裂口愈合，减轻疼痛。