舌苔发黑通常可能的原因包括食物染色、霉菌感染以及长期大量使用抗生素。
食用巧克力、咖啡、桑葚或者经常吸烟的人，经常会出现舌苔发黑的情况，这是由于食物本身或者其中的化学产物，致使舌苔染色引起的。身体抵抗力下降或者患有某些损害免疫功能的慢性疾病时，也可能出现舌苔变黑的情况，是因为霉菌在舌体表面滋生引起的。
长期大剂量使用抗生素，是另一个会引起舌苔发黑的原因。过多使用抗生素有可能造成体内的菌群紊乱，大量对抗生素药物不敏感的细菌或者真菌，在舌面繁殖而引起黑色舌苔。