婴儿做雾化是否有副作用，取决于做雾化是否采用了正规的方法。
如果进行正规的使用，是很少出现副作用的。但有些婴儿的雾化治疗并不规范，所以会出现面部毛发生长的情况，这是因为雾化的药物多选择糖皮质激素。当存留于面部，而家长未及时清理，很容易出现毛发增长的情况。
如果残留在口腔，则会导致口腔内的菌群失调，出现口腔溃疡、鹅口疮等副作用。所以在使用雾化治疗时，家长要注意婴儿的口腔及颜面部的清洁，减少副作用的发生几率。