三岁小孩半夜出现咳嗽的原因有很多，其中最常见的是过敏性咳嗽。过敏性咳嗽也称之为变异性咳嗽，是由于呼吸道内发生过敏反应，而表现为咽喉部位的瘙痒以及持续性咳嗽，特别在半夜以及凌晨时间段发生咳嗽的现象会更频繁。
通过血常规检查和总IgE检测可以明确诊断，在治疗方面主要是给予长效的抗组胺药物治疗，如氯雷他定。
患有支原体肺炎的孩子，由于夜间环境温度以及环境中粉尘颗粒的影响，也容易诱发半夜咳嗽，要给予大环内酯类抗生素治疗。