椎体骨软骨病的类型不同，病因也不相同。
如果是椎体原发骨骺骨软骨病主要是由于慢性劳损所引起。慢性劳损会导致椎体的原发骨化中心出现无菌性坏死，从而导致脊柱纵向的压力增大，就会使病变的椎体变扁，甚至破碎，从而引起椎体骨软骨病。
椎体次发骨骺骨软骨病主要是由于先天性的发育缺陷所引起。当身体过度负重时椎间盘髓核可能突入到椎体内部，导致椎体软骨板出现异常。椎间盘也会失去缓冲和保护的作用，使椎体楔形变或者是破碎，从而引起椎体骨软骨病。