对于新生儿黄疸是否需要做磁共振，需要根据病情来决定。
对于多数的新生儿黄疸，由于属于生理性，所以并不需要做磁共振检查。而如果孩子的胆红素水平比较高，并且出现了一些神经系统症状，需要排除胆红素脑病的时候，就需要做磁共振检查，磁共振检查可以发现孩子的基底核处神经节细胞的病变，有利于诊断是否存在胆红素脑病。
如果孩子的黄疸考虑是肝胆系统的异常所引起，比如存在胆总管囊肿，也可以通过做肝脏的磁共振来清楚的看出胆道系统的形态，观察是否存在胆管扩张，肝内胆管是否出现扩张或者存在胆道闭锁等病情。