一旦确诊为新生儿肺炎，应及时予以治疗，以免耽误患儿的病情。新生儿肺炎主要表现为发热、体温不升、反应差、可有发绀、气促等等。治疗主要是予以雾化吸入、体位引流、及时翻身拍背、及时吸尽口鼻的分泌物，保持呼吸道通畅。
有低氧血症的患儿，可予以鼻导管或面罩吸氧，同时予以积极的抗感染治疗，抗生素可根据血培养或痰培养的结果，选择敏感的抗菌药物。如为单纯疱疹性病毒性肺炎，可予以抗病毒治疗，同时应加强支持疗法，纠正循环障碍和水电解质及酸碱平衡紊乱，输液速度应慢，以免发生心力衰竭和肺水肿，保证充足的能量和营养供给。