撒尿的时候尿道刺痛的原因如下：
首先，应考虑可能为尿道感染所致。当尿道受到感染后，致使尿道产生炎症反应，在炎性物质的刺激下容易使尿道黏膜出现损伤。在排尿时尿液会刺激受损的尿道黏膜，进而引起尿道有刺痛感，严重者还可伴有血尿以及发热症状。
其次，可能是尿道中存在结石引起。在排尿时会促使结石移动，在结石移动时容易刺伤尿道，进而引起尿道有刺痛感，还可伴有排尿费力，以及排尿尿液分叉表现。
最后，如果存在不洁的性行为，很容易感染淋病或非淋菌性尿道炎，也容易出现尿道刺痛感，还可伴有尿道口有脓性分泌物流出。