直肠息肉并不一定是恶性的，绝大多数的直肠息肉是良性的，但直肠息肉在时间的积累下有可能会出现恶变，而发展成为直肠恶性肿瘤。
直肠息肉是一个比较笼统的概念，因为任何直肠黏膜隆起性的病变，都可以称为直肠息肉，所以直肠息肉可能是恶性的，也有可能是良性的。所以，患者发现时需要及时取息肉局部的活组织，并行病理切片检查，明确息肉的组织学类型。
对于未发生恶变的直肠息肉，可以在内镜下或者经肛门手术切除。而对于已经发生恶变的直肠息肉，可能就需要行根治性切除手术。