CT能够发现一部分的肠道肿瘤。在这些肠道肿瘤当中，CT检查对于直肠癌的诊断价值会更大些。
通过CT检查，可对一些局部浸润广泛的直肠癌及直肠癌术后盆腔复发情况进行观察，能帮助判断直肠癌的癌症病灶是否侵犯盆腔肌肉、膀胱、前列腺等器官。所以直肠癌病人在手术后，常在术后3个月左右做一个盆腔CT检查，作为基础影像，以便日后在盆腔CT的随访中进行对照。
对于结肠癌病人，只有当癌症病灶比较大时，才有可能被CT检查所发现。CT对于结肠癌病人主要是用来发现腹膜后淋巴结转移情况及是否有肝转移存在。