肩膀和脖子两侧疼痛的原因大致包括以下两个方面：
1.夜间睡眠姿势不正确，导致颈部肌肉长时间拉伸，导致落枕症状出现。还有可能是因为颈部受到外伤导致的，一般通过积极对症治疗或者适当按摩等能够缓解。
2.颈椎器质性病变导致的。例如颈椎间盘突出、颈椎增生等，由于病变部位压迫颈椎部位血管或者神经根等，导致局部出现神经性疼痛症状，表现出肩膀和脖子两侧疼痛症状。建议及时去医院就诊，明确诊断后遵医嘱给予对症治疗。