肝内胆管结石的最好治疗方法就是外科手术治疗，但具体的治疗，还是要根据病情的严重程度，以及患者的身体状况来决定。
如果结石的体积相对比较小，没有超过6mm就可以选择保守治疗。可以在专业医师的指导下口服排石以及利尿的药物，同时进行体外冲击波碎石治疗，可以完全去除病灶，将身体当中的结石完全排出。
对于体积比较大的胆管结石，如果还存在有胆管狭窄，则需要进行外科手术治疗，才可以矫正胆管狭窄。从而取出结石，达到彻底治愈的目的。