小儿麻痹症的鉴别比较困难，但是如果在当地有流行病史，根据流行病史、典型的临床表现以及实验室检查，一般情况下，诊断并不困难。但是如果症状不典型，必要的时候就要和急性感染性多发性神经根炎鉴别也就是格林-巴利综合症。
首先，从临床症状和体征来鉴别。小儿麻痹症病人一般都有发烧，脑膜刺激症、起病比较急。瘫痪的特点是不对称的，而且很少伴有感觉异常。格林-巴利综合症有对称性的上行性瘫痪，80%以上都伴有感觉丧失。
第二从瘫痪的进展或者是延伸来进行鉴别。一般脊髓灰质炎病人瘫痪的进展或者是延伸很少超过3到4天左右。格林巴氏综合症瘫痪的进展或者是扩散了可持续两周左右。
第三从脑脊液特征进行鉴别。小儿麻痹症脑积液的细胞数显著增多，而且有不同程度的蛋白增加。而格林巴利综合症。蛋白的增加，不伴有或者是只伴有轻度的细胞数增多。从这些情况就基本可以进行鉴别。还有是横贯性脊髓炎病人。在临床上可确定脊髓水平有运动或者是感觉功能的异常，而瘫痪是痉挛性的，主要是表示上运动神经元受损。括约肌功能的紊乱，也比较显著，而小儿麻痹症的病人没有这些典型的特点。
所以说要想确诊小儿麻痹症病人根据血清血检查。或者是脑积液检，粪便标本送检。然后进一步的明确诊断。