临床上导致头晕、肚子疼的原因很多，其治疗相差较大。
如果是胃肠型感冒导致的头晕、肚子疼，可以喝藿香正气水缓解。胃肠型感冒主要是病毒感染导致的，其治疗以支持对症为主。除此以外，需要及时补充水分避免脱水，必要时可给予蒙脱石散等进行止泻治疗。除了藿香正气水外，六合定中丸等中成药也具有较好的疗效。
如果是吃了被污染的食物出现头晕、肚子疼的症状，一般给予左氧氟沙星等喹诺酮类抗生素治疗，此时藿香正气水没有明显的治疗效果。