食管炎的确诊一般需要进行食管胃镜检查、活检等。食管炎是食管黏膜组织在刺激或损伤因素作用下，食管黏膜发生了水肿、充血而引发的炎症。当内镜下看到食道的黏膜损伤出现炎症或者溃疡，就可诊断为食管炎。
其次，进行病因的确诊，如反流性食管炎会出现反流、烧心等症状。化脓性食管炎患者的体温会升高且需要结合病理活检，腐蚀性食管炎还要根据患者是否有经口摄入或误服强酸、强碱类物质的病史，以及内镜下的腐蚀程度来综合地判断。
真菌性食管炎在内镜下可见白斑，可通过细胞学检查进行判断。因此食管炎患者应该尽早地接受治疗，避免延误病情，引起不必要的后果。