对于扁桃体结石是有可能自愈的。
在临床医学上，对此病的发病原因以及发病机制并不十分清楚。但可能是因为由于扁桃体长期有慢性炎症而引起的。或者是隐窝口堵塞而造成的，也可能是由于平时饮水量少或饭后不漱口等不良生活习惯诱发的。
如果扁桃体结石比较小，一般不会引起明显症状，有可能自行脱落、溶解，并不会影响到正常的生活。但若是结石体积比较大或者是引起明显的异味，使患者身体不适。此时就需要及时治疗，比如可以选择口腔冲洗、手术切除等治疗。