肠瘘会出现感染，特别是肠外瘘。
肠外瘘患者肠腔内容物会经瘘口流入腹腔而导致腹腔感染，患者会出现局限或者弥漫性腹膜炎症状，会伴有发热、畏寒、寒战等全身感染症状，感染严重会导致患者出现感染性休克，引起多脏器功能衰竭而危及生命。
轻症的可以通过药物抗感染等保守治疗，控制感染症状，严重的可能需要手术干预。而肠内瘘一般肠内容物是漏入其它肠道或者其它空腔脏器，所以感染症状相对比较轻，有些患者也没有明显的腹部症状。