怀孕后有褐色分泌物的原因比较多，比如在怀孕早期的女性，可能是因为受精卵刚刚着床而导致的着床出血。
也有可能是因为孕激素水平低下，或者是因为甲状腺功能低下而导致的先兆流产表现所造成的褐色分泌物。还有可能是因为宫颈息肉导致的孕期期间有少量褐色分泌物。有些女性可能是因为宫外孕所导致的异常出血表现，这时可能会伴有一侧下腹部的隐隐胀痛。
对于在怀孕中晚期的女性，则可能是胎盘低置或者是有先兆早产以及临产的症状而导致的褐色分泌物，出现这种情况需要及时前往医院完善相关检查，以明确原因。