怀孕6周出现褐色分泌物，考虑是先兆流产或是宫外孕导致的。可以及时做B超检查确定是否宫外孕，如果可以看到孕囊，就排除是宫外孕的几率，考虑是先兆流产引起的褐色分泌物。
孕期有褐色分泌物要保胎治疗，以免出血增多导致流产，要检查血hcg和孕酮情况。若是孕酮低导致的可以服用或是肌注黄体酮保胎。
同时要绝对的卧床休息，严禁劳累和性生活。大多数消除流产的原因后可以保胎成功，如褐色分泌物增多，就需要检查是否已经流产了的情况。