甲状腺微小乳头状癌的患者，大多数通过手术后能达到痊愈。
术后不需要给予化疗或者放疗，很少出现转移或复发等情况，患者的自然寿命一般不受疾病影响。因为甲状腺微小乳头状癌是一种恶性度极低，肿瘤生长速度较慢并且很少发生侵袭的一种恶性肿瘤。
这种恶性肿瘤的生物学特点以及行为与良性肿瘤极其相似，因此有些专家将其名称改为甲状腺乳头状瘤，将其作为一种良性的肿瘤进行治疗。根治手术可以使患者获得治愈，并且获得长期的生存时间，是预后非常好的甲状腺癌。