肛瘘术后多久能出院需要结合肛瘘的类型以及手术创伤的大小。对于一些低位单纯性的肛瘘，一般是行瘘管切开术或者瘘管切除术，手术相对简单，术后恢复也比较快，术后并发症也比较少，所以，一般术后一周左右就能出院。
而对于一些复杂性的肛瘘，由于手术创伤相对偏大，肛门局部的手术切口可能偏多，术后恢复相对偏慢，一般术后7~10天才能出院。
而对于一些高位肛瘘，甚至是高位复杂性的肛瘘。如果行肛瘘挂线术，而挂线脱落时间需要一周左右，所以，其住院时间就会更久，一般在术后两周左右才能出院，严重的甚至有可能超过两周。