肠瘘是否能自愈，主要还是要看肠瘘的大小、部位来判断，大部分的瘘都是不可以自愈的。
发生肠瘘之后，首先要查找发生的原因，再根据原因进行治疗。先给予进行保守治疗，可以先进食水，给予患者胃肠减压，同时可以进行静脉输液。静脉输液最好给予高能量、高热量的营养液，同时也需要进行抗炎治疗，以预防期出现感染，并且可给予一些能减少胃肠道分泌的药物，例如，奥美拉唑等。大多数经过保守治疗，肠瘘都是可以治愈的。
但是如果经保守治疗，没有好转的或者经常反复出现的肠瘘，则需要进行手术治疗。