新生儿紫癜的后遗症大多是由于并发症带来的，当患儿病程中发生颅内出血，和其他器官同样发生严重出血，其中大部分表现为胃肠道出血。
会导致患儿出现脑损伤，而脑损伤是不可逆的，遗留智力、生长发育、语言、运动、听力、视力的损害、胃肠道大出血，为以后消化道功能正常建立留下大大的隐患，出现胃肠道吸收不良，甚至胃肠道部分坏死的可能性，导致患儿体质消瘦、营养不良的发生。
而新生儿紫癜的原因大多是由于体内缺乏维生素K、凝血因子合成不足等情况下，出生后及时补充维生素K，以早期预防出血的发生极其重要。