脑干出血，大多数是高血压性脑出血，是因为长期的高血压，导致了脑干的基底动脉及其分支弹性降低、硬化狭窄、动脉瘤形成导致。在较高血压的冲击下，脑干这些部位的动脉容易发生玻璃样变性，容易破裂出血。
还有少部分的原因，可能是和脑动脉的畸形、血液病、脑梗死后出血、脑动脉炎有关系；如果对不恰当的患者进行抗凝或者溶栓治疗，也可能会导致脑干出血。
脑干出血，大约占脑出血的10%，绝大部分是脑桥部位的脑出血，可能会表现为突然的头痛、呕吐、眩晕、肢体瘫痪等。当出血量大的时候，患者会出现昏迷等意识障碍。严重的患者，可能因为引起脑疝等病情变化，在48小时内死亡。