睾丸长黑斑和诸多因素有关，例如睾丸长期受慢性炎症的刺激，就会引起睾丸长黑斑。
因为炎症刺激会使阴囊组织长期处于一种缺血的状态，此时会导致阴囊睾丸血液循环不良，从而使淤血存积在睾丸皮下组织，最终使睾丸形成黑斑。
另外部分人群还与睾丸黑色素分泌量过大、黑色素沉积于睾丸皮下组织有关。如果是色素沉着引起的，通常仅会引起睾丸长黑斑，是不会引起睾丸疼痛、肿胀的。但是如果是炎症刺激引起的，一般会伴随着睾丸阴囊疼痛、瘙痒。