食管结核的相关检查包括细菌学检查、组织病理学检查、结核菌素试验、血清学试验及其它检查：如血沉、血象。影像学检查包括：食管钡剂造影、CT检查、磁共振检查、内镜检查 。
食管结核的诊断需要多方面的综合性因素考虑，不能单独仅靠临床表现、影像学检查、食管内镜检查，缺乏病原学证据容易出现漏诊和误诊。
需要实验室检查，尤其是细菌学检查是食管结核诊断的核心，是确定诊断的检查项目。其中，细菌学检查、结核菌素试验、食管内镜检查取得的活检标本进行培养。如能找到结核杆菌，即可诊断食管结核。