肛拭子检查是不需要空腹的，包括新型冠状病毒核酸检测所要做的肛拭子和其他消化道疾病确诊要做的肛拭子，都不需要进行空腹。
肛拭子不受进食的影响，也不受是否排便的影响。因为肛拭子的检查就是在肛门内2~3cm的地方，用棉签进行轻轻的擦拭。采集的标本可以包括消化道内的分泌物、消化的残渣、黏膜表面的细胞和黏液等，进食和排便的情况都不会影响检测的结果。
新冠核酸检测做肛拭子只是对于一些有密切接触的高风险人群进行的，也是正在住院的确诊病人解除住院隔离的一个标准。没有密切接触的普通人的筛查，一般是不会做肛拭子的。