生殖器疱疹可以服用阿昔洛韦片和伐昔洛韦片等抗病毒类的药物治疗，也可以联合胸腺肽口服液、匹多莫德颗粒等药物治疗。
抗病毒药物治疗是关键，其中阿昔洛韦等抗病毒药物对于单纯疱疹病毒一型和二型均具有很好的抑制作用。增强机体免疫的药物可以促进疾病恢复，而且还可以减少疾病复发几率。虽然用药有效，但是预防生殖疱疹复发才是治疗的关键。
所以，在进行治疗的同时，一定要严格注意个人卫生，避免发生性生活，而且要做到定期接受复查，以了解疾病的治疗情况。对于该类疾病，需要注意休息，避免受凉等诱因。