牙齿有牙渍可能是外源性着色，也有可能是内源性着色。
外源性着色是因为牙齿表面有多种细菌，分泌多种黏性物质，主要和日常饮食习惯有直接关系，比如经常喝咖啡、喝茶，都会导致某些矿物质吸附在这些黏性物质上，所以会出现牙齿有牙渍的现象。内源性着色主要是因为牙齿在发育时形成，例如吃四环素药物在牙本质上沉淀，所以牙齿会出现发黄的症状。
牙齿有牙渍也和日常不注意口腔卫生有关系，如果长期不刷牙，长期在唾液的钙化下，就会形成牙石，牙石没有及时清理，会引起牙周炎。