身材矮小有很多因素，可能是父母遗传，也可能是发育时期营养不良或者内分泌系统疾病所致等。
如果父母身高都比较低，则子女的身高可能会遗传，也会偏低。如果发育时期摄入的营养物质不足，会导致营养不良，影响到骨骼和肌肉细胞的生长发育，从而导致身材矮小。垂体生长激素缺乏或生长激素生物效应不足所致的躯体障碍，又称儿童生长激素缺乏症。
如果身材矮小或者生长发育缓慢生长都可以影响到机体的代谢，影响身高发育。如果生长激素分泌不足，容易导致侏儒症。如果甲状腺素分泌不足，则容易诱发呆小症，这时需要到正规医院检查GH激发试验以及相关检查。