身材矮小可以有很多因素引起，不一定是甲状腺的问题。身材矮小可能是因为生长激素缺乏，也可能是因为甲状腺激素缺乏，当然也可能是体质性的一些因素，再或者是营养不良都可能引起，所以针对身材矮小的人群一定要进行鉴别诊断。
单纯性的生长激素分泌不足，患者可以出现身材矮小，这种患者的智力水平和同龄儿童没有差别，这种疾病要注意和体制性的青春期发育迟缓鉴别。
体制性的青春期发育延迟主要和遗传有关系，但是行激素的兴奋实验都是正常的。甲状腺激素缺乏引起的身材矮小，这种称为呆小症，患者不单有身材的矮小，往往还同时伴有智力的低下。