如果肛乳头肥大药物治疗无效、反复发作、生长较快、有恶变倾向时，需要及时手术治疗。
肛乳头肥大是一种增生性炎症改变的疾病，早期较小时可以观察，进行保守治疗，可肛门外用痔疮膏和痔疮栓，用中草药肛门熏洗坐浴，平时要及时治疗慢性肠道炎症，防止腹泻和便秘，便后用温水坐浴，洗净肛门。
出现肛门不适、有异物感，要及时检查、早日治疗，需要手术的患者可施行肛乳头切除术，小的肛乳头可直接切除，肛乳头较大的，则需要用丝线结扎基底部后切除。